ร้านค้าดิจิทัลของ 3DS อย่าง 'eShop' จะมาถึงในการอัปเดตระบบครั้งแรก ซึ่งปัจจุบันมีกำหนดจะเปิดตัว "ในเวลาเดียวกันทั่วโลก" ใน "ปลายเดือนพฤษภาคม" เช่นเดียวกับตัวเลือกในถ่ายโอนเกม DSiWareตั้งแต่ Nintendo DSi ไปจนถึง 3DS และอินเทอร์เน็ตเบราว์เซอร์
“เราหวังว่าเราจะสามารถมอบ [การถ่ายโอน DSiWare] ให้กับคุณได้ในช่วงเปิดตัว” อิวาตะอธิบาย “อย่างไรก็ตาม เนื่องจากสามารถทำได้ผ่าน Nintendo eShop เราจึงอดไม่ได้ที่จะขอให้คุณรอ Nintendo eShop หลังจากการอัพเดตระบบครั้งแรก” Nintendo ยังวางแผนที่จะถ่ายโอน 3DS-to-3DS โดยจะเปิดตัวในภายหลัง
อิวาตะวิพากษ์วิจารณ์ Wii Shop Channel และ DSi Shop บนเบราว์เซอร์ที่ช้าและน่าอึดอัด โดยเรียก 3DS eShop ว่าเป็น "ประสบการณ์การช็อปปิ้งที่ออกแบบใหม่อย่างมาก" และสบาย
นอกจากนี้เขายังเปิดเผยว่าอินเทอร์เน็ตเบราว์เซอร์ 3DS จะเป็นหนึ่งในฟังก์ชันที่ผู้เล่นสามารถเปิดได้จากภายในเกม พร้อมด้วยรายชื่อเพื่อน การแจ้งเตือนเพื่อน และบันทึกย่อของเกม โน้ตเล็กๆ น้อยๆ ที่คุณสามารถเขียนได้ในขณะที่เกมยังคงแสดงอยู่บนหน้าจอเดียว
