Nintendo menghasilkan satu siri seluar pendek kartun 3DS yang menampilkan Pikmin, bersempena dengan studio animasi luaran.
Nintendo menghasilkan satu set seluar pendek kartun Pikmin, yang dimaksudkan untuk dilihat pada 3DS. Pengarah urusan kanan Shigeru Miyamoto secara peribadi menyelia pengeluaran, dan mencadangkan mereka akan dikeluarkan beberapa ketika sebelumPikmin 3.
Poligonmelaporkan bahawa Miyamoto sedang bekerjasama dengan studio animasi luaran. Dia mencipta mock-up menggunakan 3DS Flipnote Studio, dan kemudian menghantarnya kepada pengarah seluar pendek supaya mereka boleh membincangkannya. Di Jepun, Nintendo bekerjasama dengan Toho Cinemas untuk menempatkan video di 60 teater.
Miyamoto berkata seluar pendek animasi bertujuan untuk memberikan watak Pikmin lebih personaliti. Pendek pertama menampilkan Kapten Olimar yang memegang pisau menghiris dan meminum apa yang kelihatan seperti pikmin merah, tetapi apabila kamera menoleh ke belakang, ia mendedahkan bahawa dia hanya memotong dan mengadun lobak merah. "Saya fikir ia akan menjadi menyeronokkan untuk mempunyai senario di mana ia kelihatan seperti dia akan makan Pikmin," kata Miyamoto. "Jadi ia agak gelap, tetapi dia tidak memakannya."
Miyamoto berkata syarikat itu tidak mempertimbangkan untuk menjadikan 3DS lebih sebagai platform hiburan, tetapi mengakui bahawa mereka menjualShaun the Sheepseluar pendek video. Video Pikmin boleh dijual "jika ia popular." Mengenai kebimbangan bahawa Miyamoto mungkin mengambil langkah ke belakang daripada Pikmin, dia meyakinkan, "Itu sama sekali tidak akan berlaku. Ia hanya projek sampingan yang menyeronokkan dengan Pikmin."